济宁市第二人民医院肛肠科成立于2004年，其前身为中医肛肠科，配有肛肠多功能治疗仪3台，多功能熏洗仪1台，直乙镜电子直肠乙状结肠镜等先进设备，科室配备有肛肠科疾病治疗区：换药室、熏洗室、门诊日间手术治疗观察室、直乙镜电子直肠乙状结肠镜室、肛周皮肤病隔离治疗室等。肛肠科自成立以来，一直坚持中西医结合的方向，发挥传统中医与西医的优势，开展各种肛门痔疮疾病的检查、诊断及治疗。目前采用中医中药及手术治疗便秘、肛裂、肛瘘、肛周脓肿、肛门狭窄、肛乳头肥大、肛周湿疹、混合痔、内痔、外痔等常见疾病，有独到经验及治疗效果，手术创伤小、痛苦轻、无后遗症，同时手术前后配合使用中药坐浴、熏洗、外敷等多种中医综合治疗，诊疗料技术先进，疗效显著。从2017年，肛肠科积极开展全程无痛手术，以多元化，微创、微痛治愈肛肠疾病，拥有业务技术熟练、高素质、高水平的医疗服务队伍，在诊治肛肠外科常见疾病中经验丰富，疗效显著，深得患者好评。